Biologia | MODELLAZIONE DEI SISTEMI BIOLOGICI

cod. 0522100025

MODELLAZIONE DEI SISTEMI BIOLOGICI

	0522100025
	DIPARTIMENTO DI CHIMICA E BIOLOGIA "ADOLFO ZAMBELLI"
	CORSO DI LAUREA MAGISTRALE
	BIOLOGIA
	2017/2018

PERCORSO COMUNE

	ANNO CORSO 2
	ANNO ORDINAMENTO 2016
	PRIMO SEMESTRE

MODULI

	SSD	CFU	ORE	ATTIVITÀ	TIPO DI ATTIVITÁ FORMATIVA
	CHIM/04	6	48	LEZIONE	AFFINE/INTEGRATIVA

	Obiettivi
	CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE. L’OBIETTIVO DEL CORSO È DI FORNIRE I FONDAMENTI CHIMICO FISICI DEI MODELLI PIÙ RILEVANTI UTILIZZATI PER DESCRIVERE SISTEMI E PROCESSI BIOLOGICI. CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE. LA COMPRENSIONE DELLA CONNESSIONE TRA LE LEGGI CHIMICO FISICHE FONDAMENTALI DELLA TERMODINAMICA, ELETTROSTATICA, EQUILIBRIO CHIMICO E CONFORMAZIONALE DI MACROMOLECOLE ED IL FUNZIONAMENTO DEI SISTEMI BIOLOGICI. LE ESERCITAZIONI PERMETTERANNO DI ACQUISIRE FAMILIARITÀ CON TECNICHE DI SIMULAZIONE MOLECOLARE PIÙ COMUNI. AUTONOMIA DI GIUDIZIO. LO STUDENTE SARÀ IN GRADO DI DISCUTERE CRITICAMENTE LA VALIDITÀ DEI RISULTATI OTTENUTI GRAZIE A DISCUSSIONI PROMOSSE DAL DOCENTE DURANTE LE ESERCITAZIONI. ABILITÀ COMUNICATIVE. IL CORSO PERMETTERÀ ALLO STUDENTE DI ACQUISIRE LA TERMINOLOGIA APPROPRIATA PER DESCRIVERE L'ANALISI DI SISTEMI E PROCESSI BIOLOGICI GRAZIE ALLA LETTURA DI ARTICOLI PUBBLICATI SU RIVISTE SCIENTIFICHE INTERNAZIONALI INDICATE DURANTE IL CORSO.

CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE. L’OBIETTIVO DEL CORSO È DI FORNIRE I FONDAMENTI CHIMICO FISICI DEI MODELLI PIÙ RILEVANTI UTILIZZATI PER DESCRIVERE SISTEMI E PROCESSI BIOLOGICI.
CAPACITÀ DI APPLICARE CONOSCENZA E COMPRENSIONE. LA COMPRENSIONE DELLA CONNESSIONE TRA LE LEGGI CHIMICO FISICHE FONDAMENTALI DELLA TERMODINAMICA, ELETTROSTATICA, EQUILIBRIO CHIMICO E CONFORMAZIONALE DI MACROMOLECOLE ED IL FUNZIONAMENTO DEI SISTEMI BIOLOGICI. LE ESERCITAZIONI PERMETTERANNO DI ACQUISIRE FAMILIARITÀ CON TECNICHE DI SIMULAZIONE MOLECOLARE PIÙ COMUNI.
AUTONOMIA DI GIUDIZIO. LO STUDENTE SARÀ IN GRADO DI DISCUTERE CRITICAMENTE LA VALIDITÀ DEI RISULTATI OTTENUTI GRAZIE A DISCUSSIONI PROMOSSE DAL DOCENTE DURANTE LE ESERCITAZIONI.
ABILITÀ COMUNICATIVE. IL CORSO PERMETTERÀ ALLO STUDENTE DI ACQUISIRE LA TERMINOLOGIA APPROPRIATA PER DESCRIVERE L'ANALISI DI SISTEMI E PROCESSI BIOLOGICI GRAZIE ALLA LETTURA DI ARTICOLI PUBBLICATI SU RIVISTE SCIENTIFICHE INTERNAZIONALI INDICATE DURANTE IL CORSO.

	Prerequisiti
	MATEMATICA DI BASE, DERIVATE ED INTEGRALI NOTEVOLI, PROPRIETÀ DI BASE DEI VETTORI. FISICA DI BASE: MECCANICA, ELETTROSTATICA

	Contenuti
	TEORIA 1.PERCHÉ I MODELLI IN BIOLOGIA 2.RICHIAMI DI TERMODINAMICA 3. MECCANICA STATISTICA 4. RANDOM WALK E LA STRUTTURA DELLE MACROMOLECOLE 5.ELETTROSTATICA DELLE SOLUZIONI SALINE 6.MODELLI DI MEMBRANE BIOLOGICHE SIMULAZIONE 7.MACHINERY: INTRODUZIONE AL CALCOLATORE: IL COMPUTER, I SISTEMI OPERATIVI, I LINGUAGGI DI PROGRAMMAZIONE ESERCITAZIONI: 1) LINUX 8.I CAMPI DI FORZA, MECCANICA E DINAMICA MOLECOLARE, MONTE-CARLO 9.UN PROGRAMMA DI DINAMICA MOLECOLARE: GROMACS

Contenuti

TEORIA

1.PERCHÉ I MODELLI IN BIOLOGIA

2.RICHIAMI DI TERMODINAMICA
3. MECCANICA STATISTICA
4. RANDOM WALK E LA STRUTTURA DELLE MACROMOLECOLE
5.ELETTROSTATICA DELLE SOLUZIONI SALINE
6.MODELLI DI MEMBRANE BIOLOGICHE

SIMULAZIONE

7.MACHINERY: INTRODUZIONE AL CALCOLATORE: IL COMPUTER, I SISTEMI OPERATIVI, I LINGUAGGI DI PROGRAMMAZIONE ESERCITAZIONI: 1) LINUX

8.I CAMPI DI FORZA, MECCANICA E DINAMICA MOLECOLARE, MONTE-CARLO

9.UN PROGRAMMA DI DINAMICA MOLECOLARE: GROMACS

	Metodi Didattici
	LEZIONI FRONTALI ED ESERCITAZIONI AL CALCOLATORE IN LBORATORIO DI INFORMATICA PER UN TOTALE DI 6CFU

	Verifica dell'apprendimento
	IL RAGGIUNGIMENTO DEGLI OBIETTIVI DELL’INSEGNAMENTO È CERTIFICATO MEDIANTE IL SUPERAMENTO DI UN ESAME CON VALUTAZIONE IN TRENTESIMI. L'ESAME PREVEDE UNA PROVA PRATICA E UNA PROVA ORALE. LA PROVA PRATICA HA DI NORMA UNA DURATA NON INFERIORE A 60 MINUTI ED È FINALIZZATA A VERIFICARE LA CAPACITÀ DI APPLICARE CORRETTAMENTE LE CONOSCENZE TEORICHE E LA CAPACITÀ DI COMPRENSIONE DELLE PROBLEMATICHE PROPOSTE. LA PROVA SI SVOLGE ANTERIORMENTE ALLA PROVA ORALE E SI CONSIDERA SUPERATA CON IL RAGGIUNGIMENTO DEL PUNTEGGIO MINIMO PRESTABILITO. LA PROVA ORALE CONSISTE IN UN COLLOQUIO CON DOMANDE E DISCUSSIONE SUI CONTENUTI TEORICI E METODOLOGICI INDICATI NEL PROGRAMMA DELL’INSEGNAMENTO ED È FINALIZZATA AD ACCERTARE IL LIVELLO DI CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE RAGGIUNTO DALLO STUDENTE, NONCHÉ A VERIFICARE LA CAPACITÀ DI ESPOSIZIONE RICORRENDO ALLA TERMINOLOGIA APPROPRIATA E LA CAPACITÀ DI ORGANIZZAZIONE AUTONOMA DELL'ESPOSIZIONE SUGLI STESSI ARGOMENTI A CONTENUTO TEORICO.

Verifica dell'apprendimento

IL RAGGIUNGIMENTO DEGLI OBIETTIVI DELL’INSEGNAMENTO È CERTIFICATO MEDIANTE IL SUPERAMENTO DI UN ESAME CON VALUTAZIONE IN TRENTESIMI. L'ESAME PREVEDE UNA PROVA PRATICA E UNA PROVA ORALE.
LA PROVA PRATICA HA DI NORMA UNA DURATA NON INFERIORE A 60 MINUTI ED È FINALIZZATA A VERIFICARE LA CAPACITÀ DI APPLICARE CORRETTAMENTE LE CONOSCENZE TEORICHE E LA CAPACITÀ DI COMPRENSIONE DELLE PROBLEMATICHE PROPOSTE. LA PROVA SI SVOLGE ANTERIORMENTE ALLA PROVA ORALE E SI CONSIDERA SUPERATA CON IL RAGGIUNGIMENTO DEL PUNTEGGIO MINIMO PRESTABILITO.
LA PROVA ORALE CONSISTE IN UN COLLOQUIO CON DOMANDE E DISCUSSIONE SUI CONTENUTI TEORICI E METODOLOGICI INDICATI NEL PROGRAMMA DELL’INSEGNAMENTO ED È FINALIZZATA AD ACCERTARE IL LIVELLO DI CONOSCENZA E CAPACITÀ DI COMPRENSIONE RAGGIUNTO DALLO STUDENTE, NONCHÉ A VERIFICARE LA CAPACITÀ DI ESPOSIZIONE RICORRENDO ALLA TERMINOLOGIA APPROPRIATA E LA CAPACITÀ DI ORGANIZZAZIONE AUTONOMA DELL'ESPOSIZIONE SUGLI STESSI ARGOMENTI A CONTENUTO TEORICO.